《药物生物技术》
1 材料与方法
1.1 植物材料
1.1.1 不同部位取材
1.1.2 胚性愈伤组织形成不同阶段取材
1.2 方法
1.2.1 BBM基因克隆
1.2.2 Pto BBM1和Pto BBM2基因的生物信息学分析
1.2.3 Pto BBM1和Pto BBM2基因表达分析
2 实验结果
2.1 Pto BBM1和Pto BBM2基因的克隆及其编码的氨基酸序列分析
2.2 Pto BBM1和Pto BBM2蛋白结构域及二、三级结构分析
2.3 BBM基因系统发育树的构建
2.4 Pto BBM1和Pto BBM2蛋白的亚细胞定位、疏水性分析及跨膜结构域预测
2.5 Pto BBM1和Pto BBM2基因表达分析
3 讨论
文章摘要:BBM (BABY BOOM)转录因子是植物细胞全能性和胚胎发生的关键调控因子。利用PCR技术从毛白杨‘BJHR01’幼叶cDNA中克隆得到PtoBBM1和PtoBBM2基因,利用生物信息学软件,对这两个基因的序列和功能进行分析。结果表明:毛白杨中PtoBBM1蛋白与毛果杨中PtrBBM1 (B9HHX9)蛋白相似性高达96%; PtoBBM2与PtrBBM2 (B9HYI0)蛋白相似性达到98%。此外, PtoBBM1和PtoBBM2蛋白均含有2个AP2保守结构域,三级结构预测它们均和乙烯反应性转录因子ERF096模型高度相似。理化性质分析推测PtoBBM1和PtoBBM2均是不稳定的亲水蛋白,不具有信号肽,亚细胞定位预测PtoBBM1和PtoBBM2蛋白均定位于细胞核,都具有跨膜结构。进化树分析显示,杨树BBM与蓖麻、棉花BBM归为一个分支,亲缘关系较近。组织表达分析表明, PtoBBM1主要在根中表达,叶和茎中表达量较低; PtoBBM2主要在叶和根中表达,茎中表达量较低, 2个同源基因表达具有组织部位的差异性。在胚性愈伤组织形成过程中,PtoBBM1和PtoBBM2基因均在胚性愈伤组织形成期表达量最高,说明PtoBBM1和PtoBBM2基因可能在杨树胚性愈伤组织形成中发挥作用。
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