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Abstract

第1章 绪论

1.1 胶质瘤

    1.1.1 神经胶质瘤概述

    1.1.2 神经胶质瘤的发病因素

    1.1.3 神经胶质瘤的临床表现

    1.1.4 神经胶质瘤的分级和分子分型

    1.1.5 神经胶质瘤的治疗

1.2 生物信息学

    1.2.1 微阵列芯片数据集

    1.2.2 GO,KEGG和GSEA分析

    1.2.3 蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络分析

    1.2.4 临床患者数据集

1.3 结构生物学

    1.3.1 结构生物学概述

    1.3.2 配体库和对接软件

    1.3.3 分子对接

    1.3.4 药理特性

    1.3.5 分子动力学模拟

1.4 信号通路介绍

    1.4.1 信号通路概述

    1.4.2 PI3K/AKT/m TOR信号通路

    1.4.3 血管生成信号通路:VEGF

    1.4.4 AURKA通路

第2章 通过生物信息学分析鉴定出胶质母细胞瘤患者的差异表达基因

2.1 引言

2.2 实验部分

    2.2.1 实验分析工具

    2.2.2 微阵列芯片数据的获取

    2.2.3 识别差异表达基因

    2.2.4 差异表达基因的GO、KEGG和GSEA分析

    2.2.5 PPI蛋白质相互作用网络构建和模块选择

    2.2.6 临床患者数据收集

    2.2.7 统计方法

2.3 实验结果

    2.3.1 差异表达基因的鉴别结果

    2.3.2 差异表达基因的功能和通路富集分析

    2.3.3 蛋白质互作用网络构建和核心驱动基因模块的筛选

    2.3.4 胶质瘤患者生存曲线分析

2.4 讨论

第3章 通过结构生物学分子对接和虚拟筛选技术筛选核心驱动基因的抑制剂

3.1 引言

3.2 实验部分

    3.2.1 实验分析工具

    3.2.2 Discovery Studio软件和配体库的选择

    3.2.3 利用Libdock模块进行以结构为基础的虚拟筛选

    3.2.4 化合物的药理特性预测

    3.2.5 化合物与靶蛋白的分子对接

    3.2.6 分子动力学模拟

3.3 实验结果

    3.3.1 天然药物数据库的虚拟筛选

    3.3.2 化合物的药理特性预测

    3.3.3 CDOCKER分析ENMD-2076 与AURKA和VEGFR-2 的精确分子对接

    3.3.4 分子动力学模拟结果

3.4 讨论

第4章 体外细胞实验验证ENMD-2076 药物的抗胶质母细胞瘤细胞作用

4.1 引言

4.2 实验部分

    4.2.1 实验用品

    4.2.2 细胞增殖实验

    4.2.3 集落形成实验

    4.2.4 体外划痕实验

    4.2.5 细胞迁移实验

    4.2.6 统计分析

4.3 实验结果

    4.3.1 ENMD-2076 对胶质母细胞瘤细胞体外增殖的抑制作用

    4.3.2 ENMD-2076 对胶质母细胞瘤细胞迁移和侵袭的影响

4.4 讨论

第5章 体内动物实验验证ENMD-2076 的抗胶质母细胞瘤作用

5.1 引言

5.2 实验部分

    5.2.1 实验用品

    5.2.2 实验动物获取

    5.2.3 制备C6-胶质母细胞瘤负荷大鼠模型

    5.2.4 核磁共振成像(MRI)扫描大鼠

    5.2.5 组织病理学与免疫组织化学

    5.2.6 统计方法

5.3 实验结果

    5.3.1 ENMD-2076 在体内试验显示出良好的治疗效果

    5.3.2 组织病理学与免疫组织化学检测结果

5.4 讨论

第6章 ENMD-2076 抑制胶质母细胞瘤细胞增值、侵袭和凋亡的具体分子机制及信号通路研究

6.1 引言

6.2 实验部分

    6.2.1 实验用品

    6.2.2 细胞免疫荧光

    6.2.3 细胞凋亡实验

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