文章目录

1 方法

1.1 获取COVID-19及其主要症状相关靶点

1.2 基因本体和通路富集分析

1.3 构建蛋白质相互作用网络和聚类功能模块

1.4 药物基因相互作用

    1.4.1 潜在化学药筛选

    1.4.2 潜在中药筛选

2 结果

2.1 COVID-19及其主要症状相关靶点和GO、KEGG分析

2.2 PPI网络分析

2.3 药物基因相互作用

    2.3.1 化学药筛选

    2.3.2 中药筛选

3 讨论

3.1 COVID-19及其主要症状的相关靶点和发生机制

3.2 COVID-19及其主要症状涉及的关键靶点

3.3 COVID-19及其主要症状涉及的通路

3.4 潜在药物筛选

    3.4.1 化学药筛选

    3.4.2 潜在中药功效及药物筛选

文章摘要:目的基于文本挖掘技术和生物医学数据库对新型冠状病毒肺炎（COVID-19）相关文献进行数据挖掘分析,探究COVID-19及其主要症状发热、咳嗽、呼吸障碍相关基因靶点,筛选潜在有效的化学药和中药。方法使用GenCLiP 3网站获取COVID-19和其主要症状咳嗽、发热、呼吸障碍共4个关键词的共有靶点,在METASCAPE数据库中对其进行基因本体（GO）和通路富集分析,再利用String数据库和Cytoscape软件构建共有靶点的蛋白质相互作用网络,筛选获得核心基因,运用DGIdb数据库、SymMap数据库针对核心基因进行中西医治疗药物预测。结果获得COVID-19及其主要症状共有基因靶点28个,其中有IL2、IL1B、CCL2等核心基因16个,使用DGIdb数据库筛选获得与16个关键靶点相互作用的化学药包括沙利度胺、来氟米特、环孢素等28种,中药包括虎杖、黄芪、芦荟等70味。结论 COVID-19及其主要症状的病理机制可能和CD4、KNG1、VEGFA等28个共有基因相关,可能通过介导TNF、IL-17等信号通路参与COVID-19病理过程。潜在有效药物可能通过作用相关靶点通路起到治疗COVID-19的作用。

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